Hub Cusub oo loogu talagalay Baadhista Qaaxada iyo Ogaanshaha Iska-caabbinta Dawooyinka: Taxane La Beegsaday Jiilka Cusub
Warbixinta suugaanta: CCa: qaabka ogaanshaha ee ku salaysan tNGS iyo barashada mashiinka, taas oo ku haboon dadka qaba qaaxada bakteeriyada yar iyo qoorgooyaha qaaxada.
Ciwaanka qoraalka: taxanaha jiilka soo socda ee qaaxada iyo barashada mashiinka: istiraatiijiyad ogaanshaha aadka u xasaasiga ah ee tuubbooyinka sambabada paucific iyo meningitis tubular.
Waqti: 《Clinica Chimica Acta》
HADDII:6.5
Taariikhda la daabacay: Janaayo 2024
Marka lagu daro Jaamacadda Shiinaha ee Akadeemiyada Sayniska iyo Isbitaalka Chest Chest ee Jaamacadda Caafimaadka Capital, Macro & Micro-Test waxay dejiyeen qaabka ogaanshaha cudurka qaaxada oo ku saleysan jiilka cusub ee tignoolajiyada isku xigxiga (tNGS) iyo habka barashada mashiinka, kaas oo bixiyay ultra-high ogaanshaha dareenka qaaxada oo ay ku yartahay bakteeriyada iyo qoorgooyaha qaaxada, waxay bixisay hab cusub oo lagu ogaanayo dareen-xumada oo lagu ogaanayo kiliinikada laba nooc ee qaaxada, waxayna caawisay ogaanshaha saxda ah, ogaanshaha caabbinta daroogada iyo daawaynta tiibishada.Isla mar ahaantaana, waxaa la ogaaday in cfDNA-da balasmaha bukaanka loo isticmaali karo nooc muunad ku habboon shaybaarka bukaan-socodka ee ogaanshaha TBM.
Daraasaddan, 227 muunado balasma ah iyo shaybaarada dareeraha maskaxda ayaa loo isticmaalay si loo dhiso laba kooxood oo bukaan-socod ah, kuwaas oo shaybaarka baaritaanka shaybaarka loo isticmaalay si loo dhiso qaabka barashada mashiinka ee ogaanshaha cudurka qaaxada, iyo shaybaarada baaritaanka kiliinikada ayaa loo isticmaalay si loo xaqiijiyo la aasaasay. model ogaanshaha.Dhammaan shaybaarada waxaa markii hore lala beegsaday barkad baaritaan oo si gaar ah loo qorsheeyay oo loogu talagalay qaaxada Mycobacterium.Kadib, iyadoo lagu saleynayo xogta isku xigxiga ee TB-tNGS, qaabka geedka go'aanka waxaa loo isticmaalaa in lagu sameeyo 5-laab xaqiijinta iskutallaabta ee tababarka iyo ansixinta safka baaritaanka shaybaarka, iyo marinnada ogaanshaha ee shaybaarrada balaasmaha iyo shaybaarrada dareeraha maskaxda ayaa la helay.Xadka la helay waxa la keenay laba qaybood oo tijaabo ah oo safka baadhitaanka bukaan-socodka lagu ogaanayo, iyo waxqabadka ogaanshaha bartaha waxa lagu qiimeeyaa qalooca ROC.Ugu dambeyntii, qaabka lagu ogaanayo cudurka qaaxada ayaa la helay.
Jaantuska 1 jaantuska naqshadaynta cilmi-baadhista
Natiijooyinka: Marka loo eego heerarka gaarka ah ee muunadda DNA-da ee CSF (AUC = 0.974) iyo muunadda plasma cfDNA (AUC = 0.908) ayaa lagu go'aamiyay daraasaddan, oo ka mid ah shaybaarrada 227, dareenka muunadda CSF waxay ahayd 97.01%, gaar ahaan 95.65%, iyo Dareenka iyo gaar ahaaneed ee muunadda plasma waxay ahaayeen 82.61% iyo 86.36%.Falanqaynta 44 muunado lammaane ah oo plasma cfDNA ah iyo dareeraha maskaxda ee DNA ee bukaannada TBM, istiraatiijiyadda ogaanshaha daraasaddan waxay leedahay joogtayn sare oo ah 90.91% (40/44) ee plasma cfDNA iyo dareeraha maskaxda ee DNA, dareenkuna waa 95.45% (42/44).Carruurta qaba qaaxada sambabada, xeeladda ogaanshaha daraasaddan ayaa aad ugu nugul shaybaarada balaasmaha marka loo eego natiijooyinka ogaanshaha Xpert ee muunadaha casiirka gastric ee isla bukaannada (28.57% VS 15.38%).
Jaantus. 2 Falanqaynta waxqabadka qaabka ogaanshaha cudurka qaaxada ee shaybaarada dadweynaha
Jaantuska 3 Natiijooyinka ogaanshaha ee muunado lammaane ah
Gabagabo: Habka ogaanshaha cudurka qaaxada ayaa lagu aasaasay daraasaddan, kaas oo bixin kara qalab lagu ogaanayo oo leh dareenka ugu sarreeya ee ogaanshaha bukaanka bukaan-socodka ee qaaxada oligobacillary (dhaqan xun).Ogaanshaha qaaxada kacsan ee ku salaysan plazma cfDNA waxay noqon kartaa nooc muunad ku haboon ogaanshaha qaaxada firfircoon iyo qoorgooyaha qaaxada (Samballada balasmaha ayaa ka fudud in la ururiyo marka loo eego dareeraha maskaxda ee bukaanka looga shakisan yahay qaaxada maskaxda).
Xiriirinta asalka ah: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990?iyada oo loo marayo%3Dihub
Hordhac kooban oo ah Makro & Micro-Test tiibishada taxanaha tiibishada
Marka la eego xaaladda muunada murugsan ee bukaannada qaaxada iyo baahiyaha kala duwan, Macro & Micro-Test waxay bixisaa xalal dhammaystiran oo NGS ah oo laga soo saarayo shaybaarrada xaakada, dhismaha maktabadda Qualcomm iyo isku xigxiga, iyo falanqaynta xogta.Alaabtu waxay dabooshaa ogaanshaha degdega ah ee bukaanka qaaxada, ogaanshaha caabbinta daawada ee qaaxada, qorista qaaxada mycobacterium iyo NTM, ogaanshaha xasaasiga ah ee qaaxada bakteeriyada iyo dadka qaaxada, iwm.
Xirmooyinka ogaanshaha taxanaha ah ee qaaxada iyo mycobacteria:
| Shayga Lam | magaca alaabta | nuxurka tijaabada alaabta | nooc muunad | model lagu dabaqi karo |
| HWTS-3012 | Tusaalaha wakiilka sii deynta | Loo adeegsaday daawaynta liquefaction ee shaybaarrada xaakada, waxa la helay lambarka rikoodhka heerka koowaad, Qalabka Mashiinnada Sutong 20230047. | xaako | |
| HWTS-NGS-P00021 | Xirmada ogaanshaha tirada Qualcomm ee qaaxada kacsan (qaabka baaritaanka) | Ogaanshaha dareen-xumo-aan-xumeyn (biobsi dareere ah) ogaanshaha xasaasiyadda bakteeriyada-qaaxada sambabada xun iyo qanjidhada maskaxda;Shaybaarada dadka looga shakisan yahay inay qabaan cudurka qaaxada ama mycobacteria aan qaaxada ahayn waxaa lagu falanqeeyay metagenomics si qoto dheer leh, iyo macluumaadka ogaanshaha in qaaxada ama mycobacteria aan qaaxada ahayn ayaa la qaaday iyo macluumaadka ugu muhiimsan ee daawada iska caabbinta daawada ee safka hore ee qaaxada mycobacterium. ayaa la siiyay. | Dhiiga durugsan, dareeraha lavage alveolar, hydrothorax iyo ascites, muunadda daloolista diiradda, dareeraha maskaxda. | Jiilka labaad |
| HWTS-NGS-T001 | Qalabka lagu ogaado mycobacterium iyo qalabka lagu ogaanayo iska caabbinta daawada | Tijaabada qorida Mycobacterium, oo ay ku jiraan MTBC iyo 187 NTM;Ogaanshaha iska caabbinta daawada ee qaaxada Mycobacterium waxay dabooshaa 13 daawooyin ah iyo 16 goobood oo isku beddelka xudunta u ah hiddo-wadaha iska caabinta daroogada. | xaako, dareere alveolar lavage, hydrothorax iyo ascites, muunad dalool diiradda, dareeraha cerebrospinal. | Jiilka labaad/saddexaad laba madal |
Qodobbada ugu muhiimsan: HWTS-NGS-T001 Mycobacterium teebaynta iyo xirmada ogaanshaha iska caabinta daawada
hordhaca alaabta
Alaabtu waxay ku saleysan tahay dawooyinka safka koowaad iyo labaad ee lagu sharraxay tilmaamaha daaweynta TB ee WHO, macrolides iyo aminoglycosides sida caadiga ah loo isticmaalo tilmaamaha daawaynta NTM, iyo goobaha iska caabbinta daawadu waxay daboolayaan dhammaan hal koox oo ah goobaha la xiriira caabbinta daawada ee WHO Mycobacterium tuberculosis-ka kooban ee buug-is-beddelka, iyo sidoo kale hiddo-wadaha kale ee iska caabbinta daroogada iyo goobaha isbeddelka ee la soo sheegay marka loo eego baaritaanka iyo tirakoobka suugaanta dhibcaha sare leh ee gudaha iyo dibadda.
Aqoonsiga qorida wuxuu ku salaysan yahay nuucyada NTM ee lagu soo koobay tilmaamaha NTM ee uu daabacay Jariirada Shiinaha ee Qaaxada iyo Cudurada Neefsiga iyo is-afgaradka khubarada.Qoryaha wax lagu qori karo ee nashqadeysan ayaa kor u qaadi kara, isku xigxiga oo sheegi kara in ka badan 190 nooc oo NTM ah.
Iyada oo loo marayo tignoolajiyada kordhinta PCR multiplex ee la beegsaday, hiddo-wadaha genotyping-ka iyo hiddo-wadaha u adkaysta daawada ee Mycobacterium ayaa lagu kordhiyay PCR Multix, iyo isku darka amplicon ee hiddo-wadaha bartilmaameedka ah ee la ogaanayo ayaa la helay.Alaabooyinka la xoojiyey waxaa loo dhisi karaa jiilka labaad ama jiilka saddexaad ee maktabadaha isku xigxiga ee sarreeya, iyo dhammaan jiilka labaad iyo jiilka saddexaad ee aaladaha isku xigxiga ayaa la marsiin karaa taxane qoto dheer si loo helo xogta isku xigta ee hiddo-wadaha bartilmaameedka ah.Marka la barbardhigo isbeddellada la yaqaan ee ku jira kaydka tixraaca ee ku dhex dhisan (oo ay ku jiraan liiska isbeddelka kakan ee WHO Mycobacterium tuberculosis iyo xiriirka ay la leedahay caabbinta daawada), isbeddellada la xiriira caabbinta daawada ama u nuglaanshaha daawooyinka qaaxada ayaa la go'aamiyay.Marka lagu daro xalka daawaynta muunada xaakada ee is-furan ee Macro & Micro-Test, dhibaatada hoos u dhigista waxtarka kordhinta aashitada nucleic ee shaybaarada xaakada (toban jeer ka badan tii hababka dhaqameed) ayaa la xaliyay, si loo ogaado isku xigxiga iska caabinta daroogada si toos ah loogu dabaqay shaybaarada xaakada ee kiliinikada.
Baaxadda ogaanshaha alaabta
34hiddo-wadaha la xiriira caabbinta daroogada ee18dawooyinka ka hortagga qaaxada iyo6Daawooyinka NTM ayaa la ogaaday, oo daboolaya297goobaha iska caabinta daroogada;Toban nooc oo qaaxada Mycobacterium iyo in ka badan190Noocyo NTM ah ayaa la ogaaday.
Shaxda 1: Macluumaadka 18+6 Daawooyinka +190+NTM
Faa'iidada alaabta
La qabsiga kiliinikada ee xooggan: shaybaarrada xaakada waxaa si toos ah loogu ogaan karaa wakiilka is-dheellitirka ah iyada oo aan dhaqan lahayn.
Hawlgalka tijaabada ah waa mid fudud: wareegga koowaad ee hawlgalka xoojinta waa mid fudud, iyo dhismaha maktabadda waxaa lagu dhammeeyaa 3 saacadood, taas oo hagaajinaysa waxtarka shaqada.
Qorista dhamaystiran iyo caabbinta daroogada: daboolaya goobaha wax lagu qoro iyo kuwa caabbinta daroogada ee MTB iyo NTM, kuwaas oo ah qodobbada muhiimka ah ee welwelka bukaan-socodka, qorista saxda ah iyo ogaanshaha caabbinta daroogada, taageeridda software falanqaynta madaxbannaan, iyo soo saarista warbixinnada falanqaynta hal gujis.
Waafaqid: waafaqid sheyga, la qabsiga ILM-ga caadiga ah iyo aaladaha MGI/ONT
Tilmaamaha alaabta
| Koodhka badeecada | magaca alaabta | Madal lagu ogaanayo | tilmaamo |
| HWTS-NGS-T001 | Qalabka lagu baaro Mycobacterium iyo qalabka lagu ogaanayo iska caabinta daawada (habka kordhinta badan | ONT, Illumina, MGI, Salus pro | 16/96rxn |
Waqtiga boostada: Jan-23-2024