Hub Cusub oo loogu talagalay Baaritaanka Qaaxada iyo Ogaanshaha Iska caabbinta Daawada: Kala-soocidda Jiilka Cusub ee La Bartilmaameedsaday (tNGS) oo lagu daray Barashada Mashiinka ee Baaritaanka Xasaasiyadda Qaaxada
Warbixinta Suugaanta: CCa: qaab lagu ogaanayo cudurka oo ku salaysan tNGS iyo barashada mashiinka, kaas oo ku habboon dadka qaba cudurka qaaxada bakteeriyada yar iyo meningitis-ka qaaxada.
Cinwaanka qoraalka: Taxanaha jiilka xiga ee qaaxada iyo barashada mashiinka: istaraatiijiyad ogaanshaha oo aad u xasaasi ah oo loogu talagalay tuubooyinka sambabada ee paucific iyo meningitis-ka tuubada.
Waqti: 《Clinica Chimica Acta》
HADDI: 6.5
Taariikhda daabacaadda: Janaayo 2024
Iyada oo lala kaashanayo Akadeemiyada Sayniska ee Jaamacadda Shiinaha iyo Isbitaalka Xabadka ee Beijing ee Jaamacadda Caafimaadka ee Capital, Macro & Micro-Test waxay aasaaseen qaab lagu ogaanayo cudurka qaaxada iyadoo lagu saleynayo jiilka cusub ee tignoolajiyada isku xigxiga ee la beegsanayo (tNGS) iyo habka barashada mashiinka, kaas oo bixiyay xasaasiyad aad u sareysa oo loogu talagalay qaaxada oo leh bakteeriyo yar iyo meningitis-ka qaaxada, waxay bixisay hab cusub oo lagu ogaanayo xasaasiyadda si loo ogaado laba nooc oo qaaxada ah, waxayna gacan ka geysatay ogaanshaha saxda ah, ogaanshaha iska caabbinta daawada iyo daaweynta qaaxada. Isla mar ahaantaana, waxaa la ogaaday in cfDNA-da plasma-ga ee bukaanka loo isticmaali karo nooc muunad ah oo ku habboon muunad qaadashada kiliinikada ee ogaanshaha TBM.
Daraasaddan, 227 muunado balaasma ah iyo muunado dareere ah oo maskaxda ku jira ayaa loo isticmaalay in lagu dhiso laba kooxood oo caafimaad, kuwaas oo muunado kooxeed oo baarita shaybaarka ah loo isticmaalay in lagu dhiso qaabka barashada mashiinka ee ogaanshaha qaaxada, muunado kooxeed oo baarita caafimaad ahna waxaa loo isticmaalay in lagu xaqiijiyo qaabka ogaanshaha ee la aasaasay. Dhammaan muunado waxaa marka hore bartilmaameedsaday barkad si gaar ah loogu talagalay oo loogu talagalay qaaxada Mycobacterium. Kadib, iyadoo lagu saleynayo xogta isku xigxiga TB-tNGS, qaabka geedka go'aanka waxaa loo isticmaalaa in lagu sameeyo 5-laab isku-xirnaanta hubinta ee tababarka iyo xaqiijinta safka ogaanshaha shaybaadhka, iyo heerarka ogaanshaha ee muunado balaasma ah iyo muunado dareere ah oo maskaxda ku jira ayaa la helaa. Heerka la helay waxaa la geliyaa laba qaybood oo tijaabo ah oo safka ogaanshaha kiliinikada ah si loo ogaado, waxqabadka ogaanshaha ee bartahana waxaa lagu qiimeeyaa qalooca ROC. Ugu dambeyntii, qaabka ogaanshaha qaaxada ayaa la helay.
Jaantuska 1aad ee jaantuska naqshadeynta cilmi-baarista
Natiijooyinka: Sida laga soo xigtay heerarka gaarka ah ee muunadda CSF DNA (AUC = 0.974) iyo muunadda cfDNA plasma (AUC = 0.908) ee lagu go'aamiyay daraasaddan, 227 muunadood oo ka mid ah, xasaasiyadda muunadda CSF waxay ahayd 97.01%, gaar ahaanshuhu wuxuu ahaa 95.65%, xasaasiyadda iyo gaar ahaanshaha muunadda plasma waxay ahaayeen 82.61% iyo 86.36%. Falanqaynta 44 muunadood oo lammaane ah oo cfDNA plasma ah iyo DNA-da dareeraha cerebrospinal ee bukaanada TBM, istaraatiijiyadda ogaanshaha daraasaddan waxay leedahay isku dheelitirnaan sare oo ah 90.91% (40/44) ee cfDNA plasma iyo DNA-da dareeraha cerebrospinal, xasaasiyadduna waa 95.45% (42/44). Carruurta qaba qaaxada sambabada, istaraatiijiyadda ogaanshaha daraasaddan ayaa aad ugu nugul muunadaha plasma marka loo eego natiijooyinka ogaanshaha Xpert ee muunadaha casiirka caloosha ee bukaanada isku midka ah (28.57% VS 15.38%).
Jaantuska 2aad Waxqabadka falanqaynta ee qaabka ogaanshaha cudurka qaaxada ee muunadaha dadweynaha
Jaantuska 3. Natiijooyinka ogaanshaha ee muunadaha la isku daray
Gunaanad: Hab lagu ogaanayo cudurka qaaxada oo aad u xasaasi ah ayaa lagu sameeyay daraasaddan, kaas oo bixin kara qalab lagu ogaan karo oo leh xasaasiyadda ugu sarreysa ee bukaanada caafimaad ee qaba cudurka qaaxada oligobacillary (dhaqanka taban). Ogaanshaha cudurka qaaxada oo aad u xasaasi ah oo ku salaysan cfDNA-ga plasma waxay noqon kartaa nooc muunad ah oo ku habboon ogaanshaha cudurka qaaxada firfircoon iyo meningitis-ka qaaxada (muunadaha plasma-ga ayaa si fudud loo ururin karaa marka loo eego dareeraha maskaxda ee loogu talagalay bukaanada looga shakisan yahay cudurka qaaxada maskaxda).
Xiriiriyaha asalka ah: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? via%3Dihub
Soo bandhigid kooban oo ku saabsan badeecooyinka lagu ogaanayo qaaxada ee Macro & Micro-Test
Marka la eego xaaladda muunadda ee adag ee bukaanada qaaxada iyo baahiyaha kala duwan, Macro & Micro-Test waxay bixisaa xalal dhammaystiran oo NGS ah oo loogu talagalay soo saarista dareeraha laga soo saaro muunadaha xaakada, dhismaha iyo isku xigxiga maktabadda Qualcomm, iyo falanqaynta xogta. Badeecadaha waxay daboolayaan ogaanshaha degdegga ah ee bukaanada qaaxada, ogaanshaha iska caabbinta daawada ee qaaxada, nooca qaaxada mycobacterium iyo NTM, ogaanshaha xasaasiyadda ee qaaxada bakteeriyada-taban iyo dadka qaaxada qaba, iwm.
Xirmooyinka ogaanshaha taxanaha ah ee qaaxada iyo mycobacteria:
| Lambarka Shayga | magaca badeecada | waxa ku jira tijaabada alaabta | nooca muunadda | qaabka khuseeya |
| HWTS-3012 | Wakiilka sii deynta muunad | Waxaa loo isticmaalay daaweynta dareeraha ee muunadaha xaakada, waxayna heshay lambar rikoodh oo heerka koowaad ah, Sutong Machinery Equipment 20230047. | xaako | |
| HWTS-NGS-P00021 | Qalabka ogaanshaha tirada Qualcomm ee qaaxada xasaasiga ah (habka qabashada baaritaanka) | Ogaanshaha xasaasiyadda aan duullaanka ahayn (daawo la soo saaray) ee qaaxada sambabada ee aan bakteeriyada lahayn iyo qanjidhada maskaxda; Muunado laga qaaday dadka looga shakisan yahay inay qabaan cudurka qaaxada ama mycobacteria-ka aan qaaxada ahayn ayaa lagu falanqeeyay metagenomics taxane qoto dheer leh, iyo macluumaadka ogaanshaha in mycobacteria-ka qaaxada ama aan qaaxada ahayn uu ku dhacay iyo macluumaadka ugu muhiimsan ee iska caabbinta daawada ee qaaxada mycobacterium-ka ee safka hore la bixiyay. | Dhiigga hareeraha, dareeraha laamiga ee alveolar, hydrothorax iyo ascites, muunad daloolin diiradda saarta, dareeraha maskaxda. | Jiilka labaad |
| HWTS-NGS-T001 | Qalabka ogaanshaha nooca Mycobacterium iyo iska caabbinta daawada (habka isku xigxiga kordhinta badan) | Tijaabada qorista bakteeriyada Mycobacterium, oo ay ku jiraan MTBC iyo 187 NTM；Ogaanshaha iska caabbinta daawada ee qaaxada Mycobacterium waxay daboolaysaa 13 daawo iyo 16 goobood oo isbeddel asaasi ah oo ku yaal hiddo-sidayaasha iska caabbinta daawada. | Xaako, dareeraha laamiga ee alveolar, hydrothorax iyo ascites, muunad daloolin diiradda saarta, dareeraha maskaxda. | Madal laba-geesood ah oo jiilka labaad/saddexaad ah |
Waxyaabaha ugu muhiimsan: Qalabka ogaanshaha nooca Mycobacterium ee HWTS-NGS-T001 iyo nooca daawada ee iska caabbinta (habka kordhinta badan)
Soo bandhigida badeecada
Badeecadu waxay ku salaysan tahay daawooyinka ugu muhiimsan ee safka koowaad iyo labaad ee lagu sharraxay tilmaamaha daaweynta qaaxada ee WHO, macrolides iyo aminoglycosides oo si caadi ah loogu isticmaalo tilmaamaha daaweynta NTM, goobaha iska caabbinta daawaduna waxay daboolayaan dhammaan koox ka mid ah goobaha la xiriira iska caabbinta dawada ee ku jira buugga isbeddelka isku-dhafka ah ee qaaxada Mycobacterium ee WHO, iyo sidoo kale hidde-sideyaasha kale ee iska caabbinta dawada iyo goobaha isbeddelka sida ku cad baaritaanka iyo tirakoobka suugaanta dhibcaha sare leh ee gudaha iyo dibadda.
Aqoonsiga qorista waxay ku salaysan tahay noocyada NTM ee lagu soo koobay tilmaamaha NTM ee ay daabacday Joornaalka Shiinaha ee Qaaxada iyo Cudurrada Neefsashada iyo isku raacsanaanta khubarada. Qalabka qorista ee loogu talagalay ayaa xoojin kara, isku xigxigi kara oo tilmaami kara in ka badan 190 nooc oo NTM ah.
Iyada oo loo marayo tignoolajiyada kor u qaadista PCR ee la beegsanayo, hiddo-sidayaasha genotyping-ka iyo hiddo-sidayaasha u adkaysta daawada ee Mycobacterium ayaa lagu xoojiyay PCR-ka multiplex, waxaana la helay isku-darka amplicon-ka ee hiddo-sidayaasha bartilmaameedka ah ee la ogaanayo. Badeecadaha la ballaariyay waxaa loo dhisi karaa maktabadaha isku-dhafka sare ee jiilka labaad ama jiilka saddexaad, dhammaan goobaha isku-dhafka jiilka labaad iyo jiilka saddexaad waxaa lagu mari karaa isku-dhafka qoto dheer si loo helo macluumaadka isku-dhafka ah ee hiddo-sidayaasha bartilmaameedka ah. Iyadoo la barbar dhigayo isbeddellada la yaqaan ee ku jira xogta tixraaca ee ku dhex jirta (oo ay ku jiraan buugga isbeddelka isku-dhafka ah ee qaaxada Mycobacterium ee WHO iyo xiriirka ay la leedahay iska caabbinta daawada), isbeddellada la xiriira iska caabbinta daawada ama u nuglaanshaha daawooyinka ka hortagga qaaxada ayaa la go'aamiyay. Iyada oo lagu daray xalka daaweynta muunadda candhuufta ee is-furan ee Macro & Micro-Test, dhibaatada hufnaanta kor u qaadista aashitada nucleic-ga ee muunadaha candhuufta kiliinikada (toban jeer ka sarreeya kuwa hababka dhaqameed) ayaa la xalliyay, si ogaanshaha isku-dhafka iska caabbinta daawada si toos ah loogu dabaqi karo muunadaha candhuufta kiliinikada.
Kala duwanaanshaha ogaanshaha alaabta
34hiddo-sidayaasha la xiriira iska caabbinta daroogada18daawooyinka ka hortagga qaaxada iyo6Daawooyinka NTM ayaa la ogaaday, iyadoo la daboolayo297goobaha iska caabbinta daawada; Toban nooc oo ah qaaxada Mycobacterium iyo in ka badan190noocyada NTM ayaa la ogaaday.
Shaxda 1: Macluumaadka Daawooyinka 18+6 +190+NTM
Faa'iidada badeecada
La qabsi caafimaad oo xooggan: muunadaha xaakada waxaa si toos ah loogu ogaan karaa wakiilka is-cabitaanka iyada oo aan la isticmaalin dhaqan.
Hawlgalka tijaabada ah waa mid fudud: wareegga koowaad ee hawlgalka ballaarinta waa mid fudud, dhismaha maktabaddana waxaa lagu dhammeeyaa 3 saacadood gudahood, taasoo hagaajinaysa hufnaanta shaqada.
Qormo dhammaystiran iyo iska caabbinta daawada: daboolaya goobaha qorista iyo iska caabbinta daawada ee MTB iyo NTM, kuwaas oo ah qodobbada ugu muhiimsan ee walaaca caafimaad, qorista saxda ah iyo ogaanshaha iska caabbinta daawada, taageeridda software-ka falanqaynta madaxa-bannaan, iyo soo saarista warbixinnada falanqaynta hal guji.
Iswaafajinta: iswaafajinta badeecada, la qabsiga aaladaha ILM iyo MGI/ONT ee caadiga ah.
Qeexitaanka Badeecada
| Koodhka badeecada | magaca badeecada | Madal ogaanshaha | qeexitaannada |
| HWTS-NGS-T001 | Qalabka ogaanshaha nooca Mycobacterium iyo iska caabbinta daawada (habka kor u qaadista badan) | ONT, Illumina, MGI, Salus pro | 16/96rxn |
Waqtiga boostada: Jan-23-2024